使用前须知
为避免外界因素(包括酶,极端pH或者温度条件等)导致产品降解,所有操作请严格遵循RNA操作规则。实验过程中,产品最好于冰上放置,使用完毕后请于-20℃~-80℃小心保存。 细胞实验方法
为了降低细胞密度、试剂用量,转染效率等因素导致的孔间差异,保证实验可靠性和可重复性,一般建议: a.转染实验中每个转染样品至少设置3个以上复孔;
b.接种细胞时,每孔接种的细胞数量尽量保持一致,并且细胞在各孔的表面平均分布。 1.转染浓度:
siRNA产品最佳工作浓度因不同的细胞类型及研究目的而异。推荐初始转染浓度为50nM,转染后检测时间为24~72h。最佳转染效率一般通过设置时间曲线和浓度梯度进行优化,优化的范围建议为5~100nM。 2.转染步骤:
以lipofectamine2000(简称lipo2000)转染siRNA于24孔板,转染浓度为50nM为例,其他规格容器转染请参考表2。
1)转染前一天,接种适当数量的细胞至细胞培养板中,每孔中加入不含抗生素的培养基,使转染时的细胞密度能够达到30~50%(不同细胞生长速度不一样,因此,接种细胞的数量需要根据细胞培养的经验)。注意:转染时,细胞密度是影响转染效率的关键因素之一,细胞生长过度会削弱细胞活力,降低细胞的转染效率。 2)对于每个转染样品,请按以下步骤准备siRNA-lipo2000混合液:
a.稀释siRNA:用50μl不含血清培养基Opti-MEMⅠ(v1)稀释μl20μM的siRNA储存液,轻轻混匀,室温孵育5min;
b.稀释lipo2000:用50μl不含血清培养基Opti-MEMⅠ(v1)稀释1μllipo2000,轻轻混匀并室温孵育5min; c.将a与b轻轻混匀,室温孵育20min(溶液可能会有浑浊,但不会影响转染)。
注意:稀释好的lipo2000长时间放置可能导致转染试剂活性的降低,应尽量在25min之内与稀释好的siRNA混合。另在混合试剂时,请勿剧烈吹打或振荡,手指轻弹管壁即可,过度用力可能会破坏脂质体的结构,甚至影响siRNA-lipo2000混合物的形成。
3)将siRNA-lipo2000混合液加入含有细胞的400μl培养基(v2)的培养孔中,轻轻混匀; 4)(可选)培养4~6h后,将孔中含siRNA-lipo2000混合液的培养基移去,更换新鲜培养基; 5)(可选)进行其他必要的特殊处理(如加药处理);
25 50 100 250 1000 6)将培养板置于37℃的CO2培养箱中培养24~96h(培养时间与实验目的相关)。 表2使用lipo2000(invitrogen)转染siRNA产品用量参考 v1:Opti-MEMI(无血清、无抗生素,转染专用);v2:完全或不完全培养基 96-well 100μl(25μl+25μl+50μl) 100μl(25μl+25μl+50μl) 100nM 50nM μl μl μl μl 10~100ng 10~100ng 24-well * 100μl(25μl+25μl+50μl) 30nM μl μl 10~100ng 100μl(25μl+25μl+50μl) 20nM μl μl 10~100ng 100μl(25μl+25μl+50μl) 500μl(50μl+50μl+400μl) 500μl(50μl+50μl+400μl) 500μl(50μl+50μl+400μl) 10nM 100nM 50nM 30nM μl μl μl μl μl 1μl 1μl 1μl 10~100ng 100~200ng 100~200ng 100~200ng 12-well 500μl(50μl+50μl+400μl) 20nM μl 1μl 100~200ng 500μl(50μl+50μl+400μl) 1mL(100μl+100μl+800μl) 1mL(100μl+100μl+800μl) 10nM 100nM 50nM μl 5μl μl 1μl 2μl 2μl 100~200ng 200~400ng 200~400ng 6-well 1mL(100μl+100μl+800μl) 30nM μl 2μl 200~400ng 1mL(100μl+100μl+800μl) 20nM 1μl 2μl 200~400ng 1mL(100μl+100μl+800μl) 2mL(250μl+250μl+1500μl) 2mL(250μl+250μl+1500μl) 10nM 100nM 50nM μl 10μl 5μl 2μl 5μl 5μl 200~400ng 500~1000ng 500~1000ng 2mL(250μl+250μl+1500μl) 30nM 3μl 5μl 500~1000ng 2mL(250μl+250μl+1500μl) 20nM 2μl 5μl 500~1000ng 2mL(250μl+250μl+1500μl) 10nM 1μl 5μl 500~1000ng *:实验参考用量示例;:当实验涉及DNA共转时参考
3.效果检测:
转染完成后24~72小时均可进行siRNA沉默效果检测,最佳检测时间与细胞类型,转染试剂,检测目的等相关。
1)RNA水平的检测:mRNA是检测siRNA沉默效率的最佳指标,siRNA转染后24~72h即可检测到靶基因mRNA表达明显降低,检测方法宜采用qPCR检测方法。注:引物设计质量很重要;
2)蛋白水平的检测:蛋白是RNAi沉默效率的重要指标,其检测手段主要为Western-blot等。检测时间受细胞内蛋白质表达量、半衰期等因素的影响,一般为48~96h,甚至更长时间之后多点采样; 3)功能筛选:应用EdU细胞增殖、EdUTP细胞凋亡等检测方法进行siRNA对细胞功能的直接筛选。
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