发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖×税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率。当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税=(年终奖-(5000-月工资))×税率-速算扣除数，税率是按年终奖-(5000-月工资)除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
年终奖扣税标准为：应纳税额＝全年一次性奖金收入×适用税率－速算扣除数。
年终奖拖后发是否违法
年终奖拖后发不一定违法，需要根据具体情况，具体分析。如果超过约定的支付期限或者超过一个支付周期的，员工可以催告公司及时发放；如果过了合理期限仍不发放，劳动者可以向劳动行政部门举报；也可以向法院起诉，或者依法申请仲裁。
法律依据：
《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。
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