公司有债务纠纷的，不会影响股权转让。公司股东要对股权进行转让的，应当按照法律规定的程序来进行转让，只要公司股东是按照法律规定的流程来转让股权的，股权转让应当具有法律效力，公司有债务纠纷的，不会对股权转让产生任何影响。因此公司有债务纠纷不会影响股权转让，公司股东可以将股权转让给其他股东或者第三人。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》
第七十一条 股权转让有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。 股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。 经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。 公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。
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