农合在地方县医院报销，与市医院住院报销不一样的。县医院是参保人最直接农合报销医院，住院报销是最高的。市医院属于跨区，住院报销次之报销比例降低点了。每进上一级医院报销就下降比例，若跨省市住院报销则更低。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条 职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。 无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
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