茶树优质抗寒种质及基因资源发掘与开发利用数据库建设
2022-01-02
来源:步旅网
・研究与开发・ 农业网络信息 AGRIC 阻唧NE'IWORK卫 RM.lATION 2013年第3期 茶树优质抗寒种质及基因资源发掘 与开发利用数据库建设 马德新 ,丁兆堂 (1.青岛农业大学传媒学院,山东青岛266109;2.青岛农业大学茶叶研究所,山东青岛266109) 摘要:当前农业信息化高度发达,构建茶树优质抗寒种质及基因资源发掘与开发利用数据库系统,对现有茶树资源信 息进行搜集、整理和发掘,实现茶树种质及基因资源的信息化发掘与利用,对茶产业的发展以及茶树育种、栽培等工作 有重要的指导意义。 关键词:茶树;种质;数据库 中图分类号:TP315 文献标识码:A 文章编码:1672—6251(2013)03—0020—02 Database Construction of Tea High Quality Anti-Cold Germplsm and aGene Resource for Exploitation and Utilization MA Dexin ,DING Zhaotang2 (1.Communication CoHege Qingdao Agricultural University,Shandong Qingdao 266109 2.Horticulture Cotrege Qingdao Agriculturla University,Shandong Qingdao 266109) Abstract:With the rapid development of agricultural information,the tea high quali ̄anti—cold germplasm and gene resource for exploitation and utilization database system,was construced,which collected,sorted and explored the tea resources information, realized free querying and iformatnion sharing of tea germplsm and gene resources,and showed an importaant guiding signiicance ffor the development of tea industy and trea tree breeding,cultivation. Key words:tea;germplsm;database a我国茶区辽阔,有着丰富的茶树品种资源,茶类 多样。随着茶的保健功能与作用机理为大众所接受与 熟悉.对茶叶的需求呈逐年递增趋势,茶业的发展前 景极其广阔。我国是茶树原产地,拥有丰富的茶树种 源。高效利用和保护种质资源,充分发掘和利用资源 的价值。该数据库系统设立了各种查询方式及过滤功 能.同时录入了茶树种质资源植株和芽叶的图片,使 得茶树资料更加丰满全面。对茶树资料进行了合理有 质资源,其遗传多样性举世瞩目,到目前为止共收集 3 300多份茶树种质资源[1]。 随着茶叶科学技术的迅速发展.建立茶树种质及 基因资源的规范化管理就显得越来越重要了。在茶树 种质资源资料分布广泛,有些资料需要尽快更新。因 效的归纳更新,实现了茶树种质及基因资源的信息化 利用与管理。 1建设目的 建立茶树优质抗寒种质及基因资源发掘与开发利 用数据库的目的在于整合汇总我国的各种茶树资料. 此在茶树种质及基因资源信息的全面化,性状的详细 化,分类的合理化基础上,通过对现有茶树种质资源 资料的收集、整理和更新,建设了茶树种质及基因资 源数据库系统。该系统的完成有利于整合茶树种质资 搜集各种不同生态环境、地理以及遗传类型的茶树资 源.同时要避免重复记录同一种材料,保证在便于交 流与管理的基础上,方便茶学科研的进行。 在建立数据库系统时.需要对茶树资料进行系统 基金项目:山东省科技发展计划(编号2011GNC11010);山东省高等学校青年骨干教师国内访问学者项目。 作者简介:马德新(1977一),男,博士,讲师,研究方向:农业物联网。 通信作者:丁兆堂,男,博士,教授,研究方向:茶学。 收稿日期:2013—02—28 《农业网络信息》2013年第3期 研究与开发 的分类,保证数据库的丰度与完整性。记录数据时, 确保采集数据详细准确,并对花朵、牙叶、植株和果 实等配备图片或视频资料。便于利用。 息的全面性与广泛性。 在搜集大量茶树种质及基因资源的基础上,完成 数据的规范化、标准化工作后录人数据库系统。在录 入过程中.为了避免输入错误以及资料间的细微差别 2建设原则 构建茶树优质抗寒种质及基因资源数据库时,在 避免同一材料过多的同时,保证最大可能的各类茶树 资源(地理、生态、遗传性状等);既要有质量,又 要有数量;要有外来品种,便于研究,便于查询;既 或误差,确保信息的可靠性与准确性,在录入完成后 进行多次全面核对工作。对于同一种质资源.若在某 个性状上有差异,进行反复验证、观察、推敲,同时 咨询相关专家,最大可能的保证材料信息的权威性与 准确性。 要保证基本数据丰富。又要有基因数据等原则。 对茶树种质资源的整理.必须处理好不同地区茶 树资源的分类,避免同名异种或者同种异名,使数据 库资料保持一致性与完整性。同时加大对茶树种质资 源的征集、评价与鉴别,基本数据的采集要详细、准 在《茶树品种志》与《中国茶树品种志》提供的 图片资料基础上,借助现代化的途径,更加广泛的采 集茶树种质资源的图片及视频信息。获得图片或者视 频资料后,使其与茶树种质资源的文字资料进行对 应。图片与视频资料的添加,使茶树种质资源的资料 更加形象生动,表现更直观。 确,既要有生物学特性,有要有生态环境信息,同时 配备必要的图片视频等资料。便于数据库建设。构建 茶树种质及基因资源数据库的目的是为了便于交流和 4建设意义 种质决定遗传性状,并将遗传信息从父代传递给 子代。而种质资料也称基因资源、遗传物质。野生近 缘物种、各种地方品种以及新培育的品种都属于种质 资源的范畴。茶树种质资源是开发利用、生物技术研 究与品种创新的物质基础,具有重要的价值与意义。 利用,因而需考虑操作规范、数据可靠、信息量大以 及交流的方便性。 3建设方法 3.1茶树种质及基因资源的描述 茶树种质及基因资源的描述,可参考陈亮等编著 的《茶树种质资源与遗传改良》回中制定的茶树种质资 源数据标准,设立包括基本数据、特征数据、评价鉴 定数据在内的110多个描述项目,增加照片和视频项 目,在种质类型项目中,增加株系选项。以全国统一 我国的茶树资源分布在不同的区域,缺乏统一有 效的管理,很难做到资源共享与有效利用,因此建设 茶树优质抗寒种质及基因资源发掘与开发利用数据库 系统,可提高资源的利用效率,更好的促进新品种的 编号作为主键,避免种质资源在数据库中的重复录 入,便于数据库内容的规范。 选择培育工作的进行。 5结束语 茶树优质抗寒种质及基因资源发掘与开发利用数 3.2软件平台技术 本茶树种质与基因资源数据库系统采用J2EE架 构,是Java2平台企业版,其核心是一组技术规范与 指南,包含各类组件、服务架构和技术层次,遵守相 同的标准与规格,有良好的兼容性。数据库系统采用 据库的建立,有利于整合茶树资源,便于茶树种质资 源的交流与对外宣传,使优质茶叶走向世界;利于利 用和保护茶树资源,促进资源转化;利于茶树资源信息 化,促进茶叶生产、科研、教育等对茶树资源的需求。 MySQL,是一种关联数据库管理系统,将数据存在不 同的表中,增加了速度、提高了灵活性,SQL语言是 用于访问数据库最常用的标准化语言。 3.3采集及录入 参考文献 【1】虞富莲,俞永明.茶树优质资源的系统鉴定与综合评价[J].茶叶 科学,1992,12(2). [2】陈亮,虞富莲,杨亚军.茶树种质资源与遗传改良【M】.北京:中国 农业科学技术出版,2006. 在《茶树品种志》【引与《中国茶树品种志》 的基础 上,广泛采集各种茶树种质与基因资源资料。查阅了 《中国茶叶》、《茶叶科学简报》等大量关于茶叶的书 籍、期刊与论文,并对资料进行反复核对与整理,保 证采集数据的权威性与可靠性。借助网络,搜集最近 [3】福建省农业科学院茶叶研究所茶树品种志[M].福州:福建人民 出版社.1979. [4】白垄元,等.中国茶树品种志【M】.上海:上海科学技术出版社, 2001 新育成品种的种质资源等信息,最大可能的保证了信 —21—