法律分析：1、通过扣缴义务人申报：
这种指的是向单位申报个人信息，每个月税务机关会把专项附加扣除相关信息全量推送至单位，单位可以从代扣缴软件获取员工已经报送的专项附加扣除信息，并从中计算出员工应预扣预缴的税款，再向税务机关办理全员全额纳税申报。
最后从工资中减去应缴的税款，剩下的就是你的到手工资了。
2、综合所得年度自行申报：
这种指的是直接向税务机关申报，即每个月单位发放工资时正常扣税，然后由纳税人自己在第二年去税务机关办理汇算清缴，并将有关信息提供给税务机关，让税务部门其办理退税。
总而言之，个人所得税扣除申报方式选哪个主要还是看你个人意愿吧，希财君建议如果是单位职工的话最好选择第一种申报方式，就不用再请假去税务部门办理退税了。而若是自由职业者或者个体户的话，可以选择第二种申报方式。
法律依据：《国务院关于印发个人所得税专项附加扣除暂行办法的通知》 第十四条 纳税人本人或者配偶单独或者共同使用商业银行或者住房公积金个人住房贷款为本人或者其配偶购买中国境内住房，发生的首套住房贷款利息支出，在实际发生贷款利息的年度，按照每月1000元的标准定额扣除，扣除期限最长不超过240个月。纳税人只能享受一次首套住房贷款的利息扣除。
本办法所称首套住房贷款是指购买住房享受首套住房贷款利率的住房贷款。