妨害公务罪中轻微伤的处理方式是根据想象竞合原则，以重罪吸收轻罪，按故意伤害或故意杀人罪定罪处罚；而刑法中对轻微伤的定义是损伤程度明显轻微，不足以造成明显伤害或器官功能障碍。根据刑法规定，故意伤害致人轻伤可处三年以下有期徒刑、拘役或管制。在实践中，轻伤案件属于自诉案件，鼓励和解，通过协商赔偿解决是最好的方式。
法律分析
一、妨害公务罪致人轻微伤怎么处理
在妨碍公务罪中规定：如果行为人的暴力行为造成国家机关工作人员重伤结果或因重伤导致死亡结果，甚至故意杀害国家机关工作人员的，应按想象竞合的原则，以重罪吸收轻罪，按故意伤害(重伤)罪或者故意杀人罪定罪，从重处罚(一个行为，数个罪名，想象竞合)。
所以如果只是轻微伤则按照妨碍公务罪处理，接受刑事处罚。根据《刑法》第二百七十七条以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。在妨碍公务按照社会危害性，以及当时的特殊情况等依据刑法规定处罚。
二、轻微伤在刑法中的规定
轻微伤：指损伤程度明显轻微，不足以造成人身健康明显伤害，也不会遗留器官功能障碍的损伤。
轻微伤害量刑标准
1、如果通过法医鉴定做出伤情是轻伤或者重伤，根据《刑法》第二百三十四条故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。通俗的说，故意伤害致人轻伤的，就可以处三年以下有期徒刑，拘役或者管制。
2、根据我国刑事诉讼法的规定有证据证明的轻微刑事案件属于自诉案件，自诉案件主要还是鼓励和解，所以原告只要自愿撤诉被告就不必负法律责任，在实践中，如果真的是轻伤，一般只要达成了赔偿协议并执行了，一般不会判刑。所以现在轻伤最好的办法就是和对方协商赔偿解决。
结语
根据以上情况，对于妨碍公务罪致人轻微伤的处理，根据刑法规定，行为人将面临三年以下有期徒刑、拘役、管制或罚金的处罚。对于轻微伤的定义，指的是损伤程度明显轻微，不会对人身健康造成明显伤害或器官功能障碍。在这种情况下，如果能达成赔偿协议并执行，一般不会判刑。因此，与对方协商并解决赔偿问题是处理轻微伤最好的方式。
法律依据
中华人民共和国刑法（2020修正）：第二编 分则 第六章 妨害社会管理秩序罪 第一节 扰乱公共秩序罪 第二百九十三条 有下列寻衅滋事行为之一，破坏社会秩序的，处五年以下有期徒刑、拘役或者管制：
（一）随意殴打他人，情节恶劣的；
（二）追逐、拦截、辱骂、恐吓他人，情节恶劣的；
（三）强拿硬要或者任意损毁、占用公私财物，情节严重的；
（四）在公共场所起哄闹事，造成公共场所秩序严重混乱的。
纠集他人多次实施前款行为，严重破坏社会秩序的，处五年以上十年以下有期徒刑，可以并处罚金。
中华人民共和国刑法（2020修正）：第二编 分则 第四章 侵犯公民人身权利、民主权利罪 第二百三十四条 故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。
犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。
中华人民共和国刑法（2020修正）：第二编 分则 第四章 侵犯公民人身权利、民主权利罪 第二百三十五条 过失伤害他人致人重伤的，处三年以下有期徒刑或者拘役。本法另有规定的，依照规定。