过本科线40分是指在高考中的总分超过了本科录取线的40分。本科线是高校招生录取的最低分数线，超过本科线可以被认为是取得了本科录取资格，可以报考本科专业。而40分则代表超过本科线的分数，超过的分数越多，表明考生在高考中取得的成绩越好。