三绿工程是由商务部会同中央12个部门联合实施的，以建立健全流通领域和畜禽屠宰加工行业食品安全保障体系为目的，以严格市场准入制度为核心，以“提倡绿色消费、培育绿色市场、开辟绿色通道”为主要内容的系统工程。为深入推进“三绿工程”建设，商务部组织全国城市农贸中心联合会、中国连锁经营协会,围绕当前流通领域食品安全状况，对22个省、自治区、直辖市的商务主管部门、2036家城市市场、1324家农村市场和4507位城乡消费者进行了为期三个多月的调查。调查表明，消费者食品安全意识及食品流通领域的交易环境、物流设施、市场管理、检测手段等方面，都有明显进步，但也仍然存在一些问题。
一、城市居民绿色消费意识明显增强，农村居民消费观念有待转变。
城市消费者高度关注食品安全问题，大部分消费者愿意为保障食品安全支付少量的额外费用。据调查，城市消费者中，最关注食品安全的占71.8％，不关注食品安全的仅占0.6％；购买食品时首选质量的占30％，选择质量和价格并重的占61.7％，选择“价格优先”的仅占8％；80％以上的消费者认为超市食品安全状况好于批发市场和农贸市场，50%左右的高收入和中等收入阶层只到超市购买食品。
农村消费者购买食品的价值取向主要是“价格优先”。据调查，农村消费者中，74.4％回答会适当考虑食品安全问题，但43.7％仍首选价格便宜。在遇到食品安全问题时，农村居民的投诉率极低。据对南京市所辖的溧水县调查，93.4％的农民在买到有问题食品时放弃投诉，高于城市35.8百分点。
二、城市食品安全工作得到切实加强，农村食品安全工作刚刚起步。
各大城市高度重视流通领域食品安全工作，严把市场关口。上海市把建设100家标准化菜市场和20家生鲜超市建设作为政府实事项目来抓；南京市每年从财政预算内安排1000万元资金专项用于蔬菜农残检测和农副产品市场等建设，建立蔬菜农残快速检测站点370个，添置检测仪57台，配备检测人员610名，覆盖了全市各蔬菜批发、零售市场和超市、大卖场；合肥市投入1.2亿元新建、改建、扩建农贸市场23个，拆除违建及骑路农贸市场14个，每月2次定期对全市16个经营生鲜的超市、农贸市场和批发市场抽样检测，并将检测结果在新闻媒体上公示；青岛市完善了以市菜篮子商品质量监督检测中心为核心、170家批零市场、生产、配送、消费单位全面布控的三级检测网络体系，今年1-9月全市累计抽查重点农副产品43.3万批次，同比增长47.9%；湖南省大力推行产品认证，索证索票、信用档案、场厂挂钩等准入措施，确定了4家著名食品工商企业为肉类食品安全信用制度建设省级试点单位，3家著名超市公司和农产品市场为食品安全信用档案省级试点单位，各市州也确定了3-4家食品安全试点企业。
农村食品安全工作正处在起步阶段，目前只有浙江、福建等少数地区将此工作提上议事日程。如浙江省构建了“农村现代流通网”、“监督责任网”、“群众监督网”三张食品安全网，福建省建立了省、市、县三级食品安全检测网络体系，有效地推动了农村食品安全工作，但绝大部分地区尚未得到应有的重视。
三、城市市场准入制度得到有效实施，农村市场食品安全状况有待改善。
组织实施食品市场准入制度，成为部分城市食品经销企业的自觉行动。被调查的城市农产品批发市场中，对食品质量安全进行承诺的达77％，对消费者实行先行赔付的达24.5％；建立进货索证索票和质量验收等制度的达43.05%，比上年度上升了18.6个百分点；开展场厂挂钩、场地挂钩的达38.41%，为上年的2.2倍；建立自检制度的占75.8％，其中开展入市检测的占66.29％。城市农贸市场中，建立不合格食品处理、商品质量巡查、投诉处理、信息公示等制度的达70％以上，对蔬菜有机磷进行检测的占45.2％，对水产品甲醛进行检测的占33.9％，对面食及豆制品中的吊白块进行检测的占31.01％，对注水肉进行检测的占45.6％，对熟食品亚硝酸盐进行检测的占25.62％；大型连锁零售企业普遍建立了对供应商进行现场审核制度，其中39％的大型连锁零售企业对所有供应商进行现场审核，部分零售商还建立了较系统的供应商审核流程，一些大型零售商已趋向于依靠第三方检测实验室对食品质量安全做定期检测。各城市流通基础设施也有了明显改观，交易厅棚发展迅猛，其中批发市场的交易厅棚平均面积较上年增长82％，农贸市场进入厅棚交易的已近八成；拥有陈列冷柜等保鲜设备、运输冷藏车等均成倍增长，鲜活食品的保鲜条件改善；批发市场内设立检测室增长了50％，农贸市场中有26.68％配备了农药残留快速检测仪。过去检测设施相对落后的西部地区速测仪与色谱仪的平均保有量比上年均增长2倍多。
由于农村居民收入远远低于城市，农村市场对低价食品有着较大需求，购买渠道主要是自由集市和小卖部。加之农村执法力量十分薄弱，市场监管缺位，农民购买食品既不查验相关证照，又不索要销售发票，致使一些“三无”食品、过期不合格食品以及被城市市场拒之门外的食品流向农村市场。调查显示，农村市场经销的食品中，65.2％为自产自销，46.1％来源于流动摊贩；散装食品所占比重达30％以上，其中散装糕点、散装熟食、散装干果的比例达到50％以上，散装酒高达80%；23.8％的包装食品没有标明保质期；19.2％的店主对过期食品选择降价销售；生肉销售大多没有保鲜措施，落市后第二天继续拿出来出售。
四、食品生产源头存在隐患，部分单位市场准入流于形式。
据对农村生产者调查，绝大部分农民不知国家明令禁止使用的农药和兽药目录；近50％的农民在使用农药和兽药时没有农业技术人员指导，只是凭感觉使用，一药多用现象相当普遍；一些农民受利益驱动，打过农药的蔬菜未过休药期即采摘上市销售。68.9％的蔬菜上市前没有经过产地检验；10％以上的种植地和养殖地周边环境存在污染源。
由于对食品安全事件处罚过轻、以罚代刑，导致部分企业负责人社会责任意识和法制观念淡薄。据调查，部分批发市场和农贸市场不愿意在食品卫生安全管理方面加大投入，只是把市场当成出租摊位、收取管理费的“摇钱树”。有的单位虽然建立了市场准入制度，但只是挂在墙上而已，并未付诸实施。一些单位虽然购置了检测设备、污物处理设施，但由于运营成本高，利用率低，有的甚至只为应付检查，平时闲置不用。
部分连锁超市在食品安全控制方面也存在一些薄弱环节。例如，在采购环节，不合格的原材料加工和不充分的供应审查导致食品质量问题时有发生；在运输环节，零售商不能完全遵从基本的储存和消毒要求；在销售环节，现有的设备和处理办法也不能充分控制食品安全；在整个价值链上，冷链完整性都没有被很好地发展；在组织结构方面，总部缺乏独立的食品安全控制部门和外部质量审计监查，使整个企业食品安全的执行变得困难；在人力资源体系方面，目前的招聘、培训和激励体系不能为食品安全控制提供足够的支持。据调查，消费者投诉主要集中在食品变质、有杂物异物、过期商品销售（包括赠品过期）等；有关部门查出的食品安全问题主要集中在标签不符、添加剂超标等，其中包装食品标签不符中缺斤少两占50%左右；从食品类别看，问题最多的是鲜肉及肉制品，占24%，其次是休闲食品和乳品类，分别占15%和11%。
五、监管部门职责仍有交叉，有待进一步理顺。
据调查，尽管国务院已明确食品安全管理遵照“分段管理为主，品种管理为辅”的原则，但由于涉及众多管理部门，有的地区涉及30多个部门，彼此理解不一，导致职责不清，难以形成合力，各自为政的现象依然存在。有的越位，有的缺位；有权的抢，有责的推；同一部门，既当规则的制定者，又当裁判员，还当运动员；城乡执法力量不平衡，不同部门执法宽严不一；一些地方和部门，还充当不安全食品的保护伞。凡此种种，使广大群众关注的问题难以尽快得到解决。例如，消费者对食品安全投诉解决方案的满意度仅为30％左右。这给食品安全工作留下了巨大隐患，既加大了搞好食品安全工作的难度，也增加了国家治理食品污染的成本。
六、有关建议
针对当前流通领域存在的食品安全问题，建议国家加大财政投入力度，将工作重心由城市转向农村，支持流通龙头企业大力发展现代流通方式，向农村延伸商业网点；由重点治理生产源头转向重点培育绿色市场，加强对上市销售食品的安全监测，实行市场退出机制，引导安全生产；加大对犯罪分子的惩处力度，使犯罪成本远大于犯罪收益；进一步理顺部门职责，形成工作合力。