一般情况下，患有大三阳是会影响到孩子的抚养权。因为乙肝大三阳属于具有较强传染性的慢性肝炎，孩子跟随该方一起生活的话，会对孩子的身体健康非常不利，况且乙肝患者也不符合变更孩子抚养权的条件。因此如果法院根据对孩子的健康成长有利，为孩子争取最大利益的原则来判决的话。大三阳是不能得到孩子抚养权的。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条 父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。