法律分析：
按政府规定文明施工费在合同签订后要一次全额支付给总包单位,后期在支付工程进度款时再扣回。在每次审核的进度款中是应扣回审定100%工程款对应的文明施工费。
法律依据：
《建筑工人实名制管理办法》 第十三条 建筑企业应配备实现建筑工人实名制管理所必须的硬件设施设备，施工现场原则上实施封闭式管理，设立进出场门禁系统，采用人脸、指纹、虹膜等生物识别技术进行电子打卡；不具备封闭式管理条件的工程项目，应采用移动定位、电子围栏等技术实施考勤管理。相关电子考勤和图像、影像等电子档案保存期限不少于2年。
实施建筑工人实名制管理所需费用可列入安全文明施工费和管理费。