法律分析：公司和工厂拆迁赔偿标准是一样的。没有单独为工厂和公司拆迁补偿设定标准。一般是按照房产证上的厂房面积和土地证上的土地面积，按照市场评估价进行拆迁补偿。都是非居住的补偿方法都是一样的，主要涉及设备重置补偿，设备搬迁安装费，停产停业员工安置补偿的费用，还会有政府发放的奖励费用。
法律依据：《房屋拆迁补偿管理条例》第三十三条规定，因拆迁非住宅房屋造成停产停业的，拆迁人可以给予适当补偿。对于“适当”的标准，何为“适当”、其计算依据、计算方法，何种情况下是“可以”补偿，何种情况下是“不可以”补偿，该条例并没有统一规定，其他法律、行政法规也没有进行规定。在法律实践中，补偿的标准、常由市一级地方政府以政策性文件规定，各地补偿标准不同，计算方法也不同，对于停产停业损失应当由评估机构进行评估确定，针对企业的经营性质、经营业务、经营状况、赢利情况进行个案评估，才能确保公平的实现，当然具体数额可由拆迁当事人协商确定。
《中国2010年上海世博会场址非居住房屋拆迁评估和补偿的实施细则》中也明确“拆迁非居住房屋，拆迁人还应补偿被拆迁人或者房屋承租人下列费用：(一)按国家和本市规定的货物运输价格、设备安装价格计算的设备搬迁和安装费用”的补偿办法。具体而言，设备搬迁和安装费的补偿金额，由拆迁人、被拆迁人或承租人依照政府指导价确定的货物运输价格、设备安装价格协商确定。协商不成的，也可委托专业的评估公司进行评估确定。