一、工伤两年还没好，公司可以辞退我吗？
是不可以的，员工达到医疗期后，还没有好，是可以申请劳动能力鉴定，认定工伤等级。劳动合同期限内用人单位不得因工伤辞退员工，属于违法解除，可以申请劳动仲裁。企业职工因工负伤或者患职业病需要停止工作接受治疗的，实行停工留薪期。停工留薪期是指工伤职工负伤或者患职业病停止工作接受治疗，继续享受原工资福利的期限。
工伤职工停工留薪期到期，存在残疾，影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定，按鉴定结论适用法律法规享受工伤保险待遇。工伤职工停工留薪期到期重返工作岗位或从事其他工作经劳动能力鉴定委员会确认属旧伤复发的，应当同时确认旧伤复发的停工留薪期期限，享受停工留薪期待遇。工伤职工停工留薪期满，拒不进行劳动能力鉴定的，停止享受工伤保险待遇。
二、公司非法辞退员工要怎么赔偿？
用人单位违法解除劳动合同的，用人单位除了要支付二倍赔偿金后，还需要依据劳动者要本单位工作的年限支付经济补偿。用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照劳动合同法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
综上所述，员工发生工伤，在停职留薪期间，享受的工资待遇是不变的，即便是工伤医疗期已过两年，公司也不可以辞退员工，而是应当保留其劳动关系，支付伤残津贴。一旦公司擅自辞退，员工可以去劳动局投诉，要求公司恢复劳动关系或者赔偿。