企业纳税零申报，与个人所得税申报无关。
零申报，是在税务机关办理了税务登记的纳税人、扣缴义务人当期未发生应税行为，按照国家税收法律、行政法规和规章的规定，应向税务机关办理零申报手续，并注明当期无应税事项。
通俗地讲，纳税申报的所属期内（如11月申报所属期为10月份）没有发生应税收入（销售额），同时也没有应纳税额的情况，称为零申报。
企业没有应税收入，并不代表企业不给员工发工资。只要企业发工资，就要依法做个人所得税的代扣代缴申报。
个人所得税是调整征税机关与自然人（居民、非居民人）之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。个人所得税法，就是有关个人的所得税的法律规定。在我国，个人年度收入超过一定的限额时，必须进行个税申报。
工资、薪金所得，以每月收入额减除三险一金个人缴纳部分及费用3500元后的余额为应纳税所得额。
纳税人可以采取多种灵活的方式办理纳税申报，如可以在地税机关的网站上进行申报，可以邮寄申报，也可以直接到地税机关的办税服务厅进行申报，或者采取符合主管税务机关规定的其他方式申报。
申报时所需资料：根据一个纳税年度内的所得、应纳税额、已缴（扣）税额、抵免（扣）税额、应补（退）税额等情况，如实填写并报送《个人所得税纳税申报表（适用于年所得12万元以上的纳税人申报）》、个人有效身份证件复印件，以及主管税务机关要求报送的其他有关资料。有效身份证件，包括纳税人的身份证、护照、回乡证、军人身份证件等。
纳税申报时需要填报的信息：一般只需填写个人的相关基础信息、各项所得的年所得额、应纳税额、已缴（扣）税额、抵免税额、应补（退）税额。个人的相关基础信息包括姓名、身份证照类型及号码、职业、任职受雇单位、经常居住地、中国境内有效联系地址及邮编、联系电话，如果是外籍人员，除上述内容外，还需填报国籍、抵华日期等信息。