本品体轻达表，气清上浮，微寒清热，长于疏散风热，故常用治风热感冒，或温病初起，温邪犯肺，发热、头痛、咳嗽等症，每与桑叶、连翘、薄荷、桔梗等同用，如桑菊饮。
用于目赤昏花
本品功善疏风清热，清肝泻火，兼能益阴明目，故可用治肝经风热，或肝火上攻所致目赤肿痛，多与桑叶、决明子、龙胆草、夏枯草等同用，共奏疏风清肝明目之效，若肝肾不足，目暗昏花，又常配枸杞子、熟地黄、山萸肉等同用，如杞菊地黄丸，共收滋补肝肾、益阴明目之功。
用于眩晕惊风本品性寒入肝经，能清热平肝，故与石决明、珍珠母、牛膝等同用，可用治肝阳上亢，头痛眩晕；配羚羊角、钩藤、白芍等同用，可用治痉厥抽搐实肝风证，如羚角钩藤汤。
用于疔疮肿毒本品甘寒益阴，清热解毒，尤善解疔毒，故可用治疔疮肿毒，常配金银花、生甘草同用，如甘菊汤。
孕妇菊花茶性寒、味甘，有极好的祛除火气之效，但孕妇自身免疫力低下、脾胃较为虚弱，食用菊花茶容易刺激肠胃，引起肚疼腹泻等症状，不利于胎儿的健康成长。
寒性体质者寒性体质者畏寒怕冷、身体孱弱、脾胃虚弱、免疫力低下，即使夏季也会有手脚冰凉、腹泻肠胃不适等症状，菊花茶性寒，只会加重其症状，对健康不利。
儿童小孩处在生长发育的高峰期，阳气正当时，喝菊花茶有削减阳气之效，最好禁止食用。
伤寒感冒者一般情况下，伤寒感冒者都是因为着凉引起的，而菊花茶的属性决定此种感冒患者不适合喝，另外，感冒并伴有咽喉炎者更加不能喝菊花茶了。因为菊花茶有刺激胃酸分泌，加重咽喉炎症的作用，延缓患者复原的时间、降低复原的质量。
过敏体质者在我们的现实生活中有人会对菊花茶过敏，如果喝了菊花茶就会引起皮肤红肿、红疹等过敏现象。所以那些过敏体质的人喝菊花茶反而会有副作用，对自己的健康不利。