首先，二者所持有的的对象不同，首付款发票只开给贷款购房者，而全款发票即购房发票，既开给贷款购房者，又开给全款买房者。
其次，二者的用途不同，首付款发票可以用于按揭和提取住房公积金，而全款发票不但可以提取住房公积金，在办理不动产证和落户时，都需要全款发票。
最后，二者重要性不同，首付款发票若是丢了，则后果不严重，但是如果丢的是全款发票，那购房1年内则不能提取公积金(由于公积金只有在购买住宅性质的商品房时才可以使用，全额购房发票开出来后才可以证明该套房产已经全款到位，且房子是属于购房者本人所有的)，如果房产证还没有拿到手，全款发票的丢失还会影响房产证的办理。
购房发票不是契税发票，购房收据是开发商开的。契税发票应是税局开的，以开发商预收契税款实际交到税局时为准，交到税局后税局才会开票给开发商转交给购房者本人。
1、提取公积金。
大家在提取住房公积金的时候需要提供购房全款发票，由于住房公积金是专款专用的资金，只能用于购买住宅性质的商品房时才可以使用，购房发票开出来后可以证明该套房产已经全款到位，且房子是属于购房者本人所有的，因此如果没有全款发票，是无法提取住房公积金的。
2、办理房产证。
购房者办理房产证与提取住房公积金对购房发票的要求程度相比，办房产证的要求要低一些。如果没有发票也可以办理房产证，但是要走许多繁琐的程序。
如果购房发票丢了，购房者可以拿着身份证、购房合同等材料去找开发商，由开发商出具发票的存根并加盖印章，再由税务机关审查核实即可。
3、迁移户口。
大多数的人户口都是跟随者房产的，买了房子之后就会考虑迁移户口的事情，购房者在办理落户的时候需要购房者提供购房合同和购房发票。有些开发商为了逃税避税不给购房者开发票，购房者这个时候一定不能妥协，因为有法律支持你们。