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Markdown是一种简洁的文本格式,通常以.md作为扩展名,并使用UTF-8编码。它适合于创建简单文章、源程序说明等,不太适用于包含复杂数学公式和图表的文章。然而,借助于R语言和相关扩展包,如knitr和rmarkdown,Markdown能够与R语言代码相结合,形成RMarkdown格式,这种格式能够将R代码的运行结果自动插入到生成的研究报告中。RMarkdown格式的源文件扩展名为.Rmd,输出格式可以多样化,包括HTML、docx、pdf、beamer等。
Markdown基本用法涉及段落、代码块显示、标题显示和分割线显示等。段落由一行或多行组成,段落之间以空行为分隔,不需要空格或制表符缩进。特殊字符在普通段落中通过在前后包裹两个反向单撇号表示,代码块则用三个连续的反向单撇号表示开始与结束。标题通过在行首使用不同数量的井号来表示级别,分割线则由三个或更多连续的星号组成。列表显示则使用减号、星号或数字加点号来标记。
在RMarkdown中,可以将元数据、正文内容和R代码整合在一起。元数据通常自动生成,包含文件标题、作者和创建日期。正文内容则使用Markdown语法编写,代码段则通过{r}标签插入R代码,并显示运行结果。R代码段可以指定标签和选项,如fig.with和fig.height来指定图像宽度和高度,out.width和out.height则用于指定输出显示的宽度和高度。此外,可以使用xtable包生成HTML或LaTeX格式的表格。
RMarkdown文件的编译可以在RStudio中进行,通过“File–New File–R Markdown”新建文件,扩展名为.Rmd,然后使用快捷图标Knit将文件转换为HTML、PDF或MS Word格式。转换为PDF格式时,通常需要安装LaTeX编译器,例如TinyTeX。在文件开头添加设置可以确保中文编码正确显示在PDF中。