刑事案件被害人不能申请撤诉，因为刑事公诉案件由公安机关立案侦查，检查机关向法院提起公诉。在刑事自诉案件中，自诉人依法传唤两次，无正当理由拒不出庭，或者未经法院许可中途退庭的，按照撤诉处理。
人民法院审查自诉案件后，应当按照下列情形分别处理：
1、犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审理；
2、缺乏罪证的自诉案件，自诉人不能提供补充证据的，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。
自诉人依法传唤两次，无正当理由拒不出庭，或者未经法院许可中途退庭的，视为撤诉。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑事诉讼法》
第二百一十一条 人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：
（一）犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判；
（二）缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。
自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。
法庭审理过程中，审判人员对证据有疑问，需要调查核实的，适用本法第一百九十六条的规定。
第一百九十六条 法庭审理过程中，合议庭对证据有疑问的，可以宣布休庭，对证据进行调查核实。
人民法院调查核实证据，可以进行勘验、检查、查封、扣押、鉴定和查询、冻结。
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