法律分析：建设工程分包合同纠纷可以按照以下方法处理：1、双方当事人对于分包合同有约定仲裁协议的，因履行分包合同发生纠纷的，当事人应当去仲裁委员会申请仲裁，由仲裁委员会对纠纷作出裁决；2、双方当事人未约定仲裁协议的，只能去人民法院提起民事诉讼，请求人民法院对纠纷作出判决，人民法院审理后，应当按照相关规定对纠纷作出判决。
法律依据：《中华人民共和国仲裁法》
第二条 平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
第二十一条 当事人申请仲裁应当符合下列条件:
（一）有仲裁协议；
（二）有具体的仲裁请求和事实、理由；
（三）属于仲裁委员会的受理范围。
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