公司停业办理流程如下：
1、到办税服务厅“税务登记”窗口领取并填写《停业申请审批表》和《税务文书附送资料清单》；
2、 持以下资料：①税务登记证副本；②《发票领购簿》；③尚未查验缴销的发票和收款收据；④税务机关要求报送的其他有关证件资料；⑤《停业申请审批表》；⑥《税务文书附送资料清单》，到办税服务厅“税务登记”窗口办理暂停营业手续；
3、 到办税服务厅“发票发售”窗口办理发票缴销手续；
4、 到办税服务厅“申报征收”窗口办理税款征收手续；
5、 将《停业申请审批表》交税务分局分管局长审签后，交办税服务厅“税务登记”窗口录入电脑，并领取《核准停业通知书》。
公司停业员工补偿具体如下：
1、经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；
2、六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿；
3、劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
综上所述，对停业期满未申请延期复业的纳税人，主动实施复业处理，视为正常营业纳税人管理。将原封存的税务登记证件交纳税人。
【法律依据】：
《税务登记管理力法》第二十三条
实行定期定额征收方式的个体工商户需要停业的，应当在停业前向税务机关申报办理停业登记，纳税人的停业期限不得超过一年。
因篇幅问题不能全部显示，请点此查看更多更全内容