支付宝余额被司法协查冻结，是被人民法院进行了司法冻结。人民法院可以查封、扣押、冻结被执行人占有的动产、登记在被执行人名下的不动产、特定动产及其他财产。未登记的建筑物和土地使用，依据土地使用的审批文件和其他相关证据确定属。
对于第三人占有的动产或者登记在第三人名下的不动产、特定动产及其他财产，第三人书面确认该财产属于被执行人的，人民法院可以查封、扣押、冻结。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十二条 被执行人未按执行通知履行法律文书确定的义务，人民法院有权向有关单位查询被执行人的存款、债券、股票、基金份额等财产情况。人民法院有权根据不同情形扣押、冻结、划拨、变价被执行人的财产。人民法院查询、扣押、冻结、划拨、变价的财产不得超出被执行人应当履行义务的范围。
人民法院决定扣押、冻结、划拨、变价财产，应当作出裁定，并发出协助执行通知书，有关单位必须办理。
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