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Perl编程题-题目(1)

2020-02-03 来源:步旅网


编程题

1. 输出文件行数。

2. 输出FASTA、FASTQ序列文件包含的序列条数。

3. 将文件从最后一行一直输出到第一行。

4. FASTA序列反向互补。

5. FASTQ序列转FASTA序列。

6. 输入文件:

输出要求:为文件中第一列(基因ID)添加描述信息。

6. 根据基因ID将不同文件中该基因的某一统计信息整合输出到一个文件中。

输入文件:

输出要求:将两个文件中都有的基因输出,并输出其在不同文件中的log2值。

7. 给出一个read,求其平均质量值。

输入文件:

8. 给出两组序列,找出其中的公共序列(按名称处理)。perl

输入文件:

9. 给出一条fa序列,提取其中的10-150这部分位点的序列出来(起始位点为1)。

输入文件:

10. 统计fa格式的序列长度。

输入文件:

11. 将一个文件,按照任意给定的数字(行数),等分成几分,注意最后一份可能数据不足给出的行数。比如:一个文件10行,输入3,给出4个文件:1-3,4-6,7-9,10

输入文件:

12. 求一个序列的GC含量,和N的比率。

输入文件:

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